La chapelle de la Maison Mère-Mallet est logée dans l'aile centrale de l'édifice où habitent les Sœurs de la Charité de Québec. Mère Marcelle Mallet a créé en 1849 une congrégation religieuse imprégnée du charisme de la charité universelle de sainte Marguerite d'Youville. Elle fut à l'origine du projet de construction de cette haute chapelle de 67 pieds et d'un blanc immaculé qui est un bijou architectural peu fréquenté de la vieille capitale.

La chapelle de style néogothique est l'œuvre de l'architecte Charles Baillairgé qui n'a pas hésité à innover dans l'élaboration de ses plans architecturaux. Trois incendies ont ravagé le temple jusqu'aujourd'hui et la dernière reconstruction, fidèle aux travaux de Baillairgé, date de 1915.

Le sculpteur et architecte québécois François-Xavier Berlinguet a réalisé les autels.